合肥市第一人民医院（南区）消化内科现有1个消化病区，床位48张，拥有1个消化内镜诊疗中心，现有医师共11人，其中主任医师1人，副主任医师5人，主治医师5人。承担病区和专科门诊及内镜中心的诊疗工作，科室专注于消化系统疾病的预防、诊断与治疗，开展了包括食管、胃、肝脏、胆囊、胰腺、肠道等器官的常见病、多发病、疑难重症和内镜综合诊断及治疗。科室以消化道早癌、炎症性肠病、肝胆胰疾病、功能性胃肠病等为核心诊疗方向。
目前学科常规开展常规及无痛胃肠镜，13C-尿素呼气试验，染色（NBI）+放大内镜精查，内镜下食管狭窄扩张及支架植入术，内镜下空肠营养管植入术，内镜下息肉电凝电切、圈套术，内镜下粘膜切除（EMR），内镜下钛夹止血术，内镜下异物取出术，内镜下食管静脉曲张硬化剂治疗术及套扎治疗术，内镜下胃底静脉曲张组织胶治疗术，内镜下内痔泡沫硬化治疗术，内镜下粘膜剥离术（ESD）、内镜下粘膜挖除术（ESE），内镜逆行性胆管胰管造影术（ERCP），内镜逆行性胆管结石取石术、置管引流术，超声内镜技术，磁控胶囊胃镜、胶囊小肠镜技术。现为合肥市第七周期重点培育专科，国家区域医疗中心消化内科专科联盟成员单位，国家消化病临床医学研究中心幽门螺杆菌规范化诊治门诊市级示范中心，安徽省炎症性肠病联盟副理事单位，安徽省消化系统肿瘤内镜诊治联盟理事单位。
